农业工程实验中心现有室内实验室17间，总面积780m²，设有农田水利实验室、节水灌溉实验室、离心泵实验室、泵与泵站模型室、土壤农作实验室、水土保持实验室、设施农业实验室、大学生创新训练室等教学实验室和仪器室、样品室、消煮室等专门实验室。

实验中心现有教学仪器设备200多台（套）包括节水灌溉模拟实验系统、离心泵性能实验系统、水泵及泵站模型、离子色谱仪、水质分析仪、工具显微镜、激光粒度仪、紫外/可见分光光度计、超低温冰箱、人工气候箱、冷冻离心机、酸度计、电导率仪、鼓风干燥箱、土壤入渗仪、凯氏定氮仪、通风消煮柜、人工模拟降雨系统等，总价值510多万元。

实验中心主要服务于农业水利工程专业《农田水利学实验》、《水泵与水泵站实验》、《土壤学与农作学实验》、《土壤侵蚀实验》、《设施园艺学实验》等实验课程的教学工作。同时，中心面向全校本科生开放，为其开展与农业水利、农业环境、农业生态相关的创新训练及毕业论文试验研究提供必要的实验场所和仪器设备。